企业在每年的1月至3月期间，通过国家科技部的专精特新认证管理平台进行在线申报，提交相关的申报材料，包括企业基本信息、专精特新特征描述、财务报表、知识产权证明、产品或服务介绍、市场分析、创新成果等。

- 国家科技部对申报材料进行初审，对不符合条件或不完整的申报材料进行退回或补正，对符合条件的申报材料进行受理，并将申报材料转交给省级科技部门。

- 省级科技部门对申报材料进行复审，组织专家进行现场考察和评审，对申报企业进行打分和排名，形成专精特新认证的推荐名单，并报送国家科技部。

- 国家科技部对推荐名单进行审核，确定专精特新认证的最终名单，并在每年的6月至7月期间向社会公布，并向认证企业颁发专精特新认证证书。

- 专精特新认证的有效期为三年，认证企业在有效期内可以享受相关的政策支持，但需要每年进行一次绩效评估，以确保企业的专精特新特征和水平没有下降。认证企业在有效期满后，可以重新申报专精特新认证，但需要重新提交申报材料，按照新的认证标准和流程进行评审。